ESmol

Visualiseur moléculaire rapide prenant en charge les protéines, les acides nucléiques et les petites molécules.

ESmol - Viewer moléculaire pour Android

REMARQUER!

Si votre appareil peut fonctionner NDKmol, s'il vous plaît l'utiliser. Il est beaucoup plus rapide et

ont plus de fonctionnalités que ESmol.

Vous pouvez obtenir de NDKmol https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ESmol est maintenu pour la compatibilité avec les appareils très anciens.

== == A propos de

ESmol est une visionneuse moléculaire pour les applications.

Vous pouvez visualiser les structures tridimensionnelles des protéines, des acides nucléiques et de petites molécules. ESmol supporte la plupart des représentations communes pour les molécules, comme ruban, trace, bâton, sphère et de la ligne. ESmol prend également en charge les opérations de symétrie; ensembles biologiques et emballage de cristal peuvent être affichés. Vous pouvez rechercher et télécharger des structures de RCSB APB et NCBI PubChem.

ESmol a presque la même fonctionnalité que GLmol, qui est écrit en

WebGL / Javascript et fonctionne sur les navigateurs Web. Vous pouvez GLmol à http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Caractéristiques ==

* Lire fichier PDB

   (ESmol ne peut pas ouvrir des molécules LARGE (plus de 3 Mo). A cet effet, s'il vous plaît utiliser NDKmol à http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)

* Lire fichier SDF / MOL

* structures de recherche et de téléchargement de RCSB PDB et NCBI PubChem

* Faire pivoter / Traduire / Zoom modèle par doigt

* Représentations

    - Ligne

    - Memory stick

    - Sphère (van der Waals rayon)

    - Alpha trace de carbone

    - ruban

    - Brin

    - tube de facteur B

    - Echelle d'acides nucléiques

    - Ligne d'acide nucléique

    - solvant « étoiles »

* Coloring

    - Par chaîne

    - Par structure secondaire (lorsqu'elle est définie dans les registres FEUILLE / HELIX)

    - par des éléments

    - Dégradé (a.k.a chainbow)

    - facteur B

    - polaire / apolaire

* cristallographie

    - Affichage cellule de l'unité

    - Afficher emballage cristal (lorsqu'elle est définie dans la section REMARK)

    - Affichage ensemble biologique (lorsque défini dans la section REMARQUE)

== Comment utiliser ==

Lors de son lancement, ESmol charge automatiquement désoxyhémoglobine (PDBID: 4HHB) à titre d'exemple. Vous pouvez faire pivoter la molécule par votre doigt.

Pour zoomer ou traduire la molécule, appuyez sur la touche MENU dans votre téléphone / tablette et sélectionnez le mode. gestes à deux doigts sont également pris en charge.

Pour charger d'autres fichiers PDB, s'il vous plaît placer le fichier dans le répertoire « APB » de la carte SD et sélectionnez la commande « Ouvrir » dans le menu. Vous pouvez également télécharger directement à partir de structures RCSB APB et NCBI PubChem serveur web. Sélectionnez « Rechercher et télécharger » dans le menu.

== == Contacter

Site web du projet est situé à http://webglmol.sourceforge.jp/. Vous pouvez également obtenir les codes sources.

Commentaires et suggestions sont les bienvenus à http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou [email protected]

=== === avis LICENCE

ESmol lui-même est distribué sous licence GNU Lesser General Public License comme suit.

Cependant, les fichiers PDB inclus à titre d'exemples sont dans des conditions différentes.

S'il vous plaît consulter

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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ESmol - Viewer moléculaire pour Android

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     COMMERCIALISATION ou D'ADAPTATION À UN USAGE PARTICULIER. Voir le

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     Vous devriez avoir reçu une copie de la licence GNU Lesser General Public

     avec ce programme. Dans le cas contraire, voir .