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Explorez les profils d'expression des gènes dans différents types de cellules du système immunitaire de la souris

Explorez les niveaux d'expression des gènes dans différentes cellules du système immunitaire de la souris. Commencez par entrer un nom de gène (ou un alias) dans la barre de recherche pour voir une liste de résultats que vous pouvez parcourir.

La recherche affichera un "code-barres de carte thermique" qui montre à quel point l'expression de ce gène est chaude ou froide dans différentes lignées cellulaires du système immunitaire (cellules B, cellules T, cellules myéloïdes, etc.). Basculez entre les ensembles de données générés sur 2 plates-formes différentes : RNAseq et microarray.

Appuyez sur une icône de lignée cellulaire pour voir les mêmes données d'expression visualisées sous forme de graphique à barres. Utilisez le menu des paramètres en haut à droite pour basculer entre un axe logarithmique et linéaire. Dans les données du microréseau, les faibles valeurs d'expression sont partiellement occluses.

De retour sur l'écran principal "code à barres heatmap", si vous appuyez à la place sur le bouton "Afficher les gènes associés", vous verrez une vue "constellation de gènes". Cela montre ses gènes les plus corrélés au sein de certains groupes de population. Par défaut, la corrélation est indiquée par rapport aux populations clés - ce sont des populations clés dans l'ensemble du système immunitaire.

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Les données sont générées par l'Immunological Genome Project, un consortium international soutenu par les National Institutes of Health (NIAID).